Įmonė, norinti būti atestuota, pateikia nustatytos formos prašymą Lietuvos saugios laivybos administracijai. Kartu su prašymu pateikiami: įmonės įstatų (jei jie įmonei privalomi pagal įstatymą) ir įmonės įregistravimo pažymėjimo nuorašai; pasirašyta įmonės vadovo pažyma apie įmonėje esamas technines priemones, reikiamas patalpas, laivus, kitą įrangą bei specialistus, kurie būtini atestuojamai veiklai vykdyti.

Įmonei pateikus prašymą dėl jos atestavimo bei reikiamus dokumentus, Lietuvos saugios laivybos administracija per 30 dienų nuo jų gavimo privalo juos išnagrinėti ir priimti sprendimą išduoti įmonės atestavimo pažymėjimą arba pateikti pareiškėjui motyvuotą raštišką atsisakymą tai padaryti. Atsisakymas išduoti įmonės atestavimo pažymėjimą negali būti grindžiamas įmonės veiklos netikslingumu.

Atestavimo pažymėjimams gauti pateiktus dokumentus nagrinėja ir esamą padėtį tiria Įmonių atestavimo komisija, sudaryta  Lietuvos saugios laivybos administracijos direktoriaus.

Įmonių atestavimo pažymėjimai išduodami trejų metų laikotarpiui. Atestuojant įmonę pirmą kartą, atestavimo pažymėjimas išduodamas ne ilgesniam kaip 1 metų laikotarpiui.

Lietuvos saugios laivybos administracija turi teisę atsisakyti išduoti pažymėjimą, jeigu:

1. Pateikiami ne visi reikiami dokumentai ar jie neatitinka jiems nustatytų reikalavimų.
2. Pateikiami neteisingai užpildyti dokumentai.
3. Pateikiami neteisingi duomenys.
4. Įmonės laivų, techninių priemonių būklė ir darbuotojų kvalifikacija neatitinka reikalavimų atestuojamai veiklai.
5. Įmonei buvo panaikintas atestavimo pažymėjimo galiojimas pagal šios Tvarkos 40.2, 40.3 ir 40.4 punktų reikalavimus.

Atsisakius atestuoti įmonę pakartotinai galima kreiptis bendra tvarka, ištaisius nurodytus trūkumus ar įvykdžius reikalavimus (atestavimo pažymėjimas neišduodamas 1 metus nuo jo galiojimo panaikinimo dienos).